給文鳶等高級將領做了做思想工作，也沒什麼說不通的，他們不是崇尚西方制度嗎，西方國家的軍隊哪國是直接歸皇帝管的，所以他們的心裏障礙還是在利益方面，主要是不想受制於文官政府，但英國是這樣，法國是這樣，德國軍隊也是總參謀部權限最大，朱敬倫恩威並施他不接受也不行。
軍隊的爪牙是不是剪斷了目前還不好說，但至少已經給他們套上了一個籠頭，讓他們不至於跟文官政府擰着來，否則預算也沒有，後勤補給也沒有，甚至文官政府還能夠決定不配合軍官的升遷，軍隊算是統一進政府裏了。
因此太平天國的局勢變化，現在兵部就有了絕對的發言權，去年總參謀部就給他們做過計劃，一旦太平天國局勢惡化，大明的目標是至少分割太平天國一個省的國土，最現實的當然是浙江，從福建北上就能攻取浙江，跟大明國土是連爲一體的。得到蘇南地區也不算壞，跟江西同樣能夠連成一體。當然最完美的是，全部都得到，這樣大明就掌控了長江下游地區的整個江南地區。
如果只需要分割一省，大明基本上什麼都不需要做，靜待湘軍將太平軍主力殲滅，然後明軍北上摘桃子，如果兩省都想要，明軍得做好等太平軍失敗後，然後調集兵力跟湘軍進行決戰，爭奪江南。
但如果想要全圖兩省，不知道要等多長時間，誰也不清楚湘軍在江南會跟太平軍糾纏多久，這兩個死對頭已經纏鬥了二十多年，誰也不敢肯定是不是會繼續纏鬥下去。軍事計劃中，估計到了這種持久戰的情況，那麼明軍可以選擇先攻佔太平軍的浙江，在打江蘇，弄不好最後明軍要先打太平軍，再跟湘軍打一場。
現在的明軍已經不怕開戰了，全體上下別說打江南了，就是打北亰都不覺得有難度，北伐中原的呼聲就沒停止過。
但列強會那麼容易就讓大明一統全國嗎，別說一統全國，恐怕是江南地區，他們都不能接受被明軍全部佔據。
另外朱敬倫也看到了，此時一統全國，對大明來說，不是利好，很可能是利空，一個救災就讓大明有些挺不過來，整個國民經濟大受影響，統一了全國，就背上了幾億教育程度低下的民衆，經濟發展落後的地區的包袱，不是背得起背不起的問題，而是在大明工業化正在發展的時候，背上這個包袱的機會成本太大。
朱敬倫很早的戰略就是，以東南沿海地區，最容易發展經濟的省份爲根基，儘快完成工業化，才能積攢出一統全國的實力，近二十年過去了，大明的經濟發展水平，還只是世界二流，放在歐洲大概能夠意大利這種窮光蛋帝國主義比一比，只比希臘等東南歐國家強一些，跟英法德等先進國家差距很大。
另一個顧慮就是，現在就發動北伐，正在經歷災荒的老百姓還得死多少中國民族的元氣還得損失多少
跟湘軍爭江南是一定要的，這裏顯然附和大明優先以容易發展經濟的地區爲根基的戰略觀念，但要一口吞掉江蘇和浙江兩地，不管會不會引起列強幹涉，光是一個可能讓這個地區陷入持續不斷的拉鋸戰一條，朱敬倫就不能接受。
江南毫無疑問是中國的精華區域，經過太平軍跟清軍多年的拉鋸，損失人口達到七成，雖然很多是逃走了，但死亡的恐怕也有一半。這是精華地區，不只是經濟，文化上也是，因此江南動亂造成的中國精英流失難以估量。
根據修訂的計劃於是變成了，一旦湘軍對太平軍取得決定性優勢，大明立刻介入，在湘軍消滅太平軍之前，攻取對方防禦薄弱的浙江，然後再跟清軍坐下來談談分割領土的問題。
可不等大明找清軍談，曾國藩反倒是給朱敬倫寫了一封信，在大明待過多年的曾國藩，對朱敬倫的性格有一定的瞭解，雖然有時候覺得朱敬倫有些沽名釣譽，但是他相信朱敬倫心裏是抱着施仁政的思想的。
於是曾國藩在信中跟朱敬倫講仁義大道，評論自從拜上帝邪教倡亂以來，江南久經戰亂，百姓十不餘一，大明也是禮儀之邦，不該與這些孽障爲伍。曾國藩還直言不諱的表示，或許將來明清會爭天下，但那也爭的也是一個有仁義道德有忠孝禮儀的天下，而不是一個仁義充塞，率獸食人，甚至人相食的天下。所以他建議跟明軍聯合滅髮匪太平軍，曾國藩表示大清很願意跟大明在江南劃僵而治，永爲友邦。
朱敬倫很想陰曾國藩一把，比如把這封私信公開，這可是與他國妄議劃分疆土啊，曾國藩的名聲恐怕又會臭了，不知道這個老夫子還能不能經得起這一次打擊，更陰的是，曾國藩可以回一封信，表示如果是跟曾氏劃分疆土，大明非常願意，如果是跟滿清劃分疆土，大明
絕不答應，恐怕這封回信發出去，會徹底毀了曾國藩的。
但曾國藩怎麼可能想不到這些，他敢於冒風險給朱敬倫寫信，那是把朱敬倫看作一個仁人君子，朱敬倫如果陰他一把的話，就顯得太下作了。
不過朱敬倫真的給曾國藩回了一封信，沒有談劃分疆土的問題，而是表示希望湘軍在作戰過程中，能夠少造誅戮之事，以全人命爲上。
曾國藩最讓人難以理解的，就是他屠殺的行爲，一個飽讀詩書的文人，怎麼會做出那麼令人髮指的事情呢，安慶大屠殺很能說明問題。
湘軍進城後，俘虜了上萬人，曾國藩讓全部都殺掉，曾國荃反倒是不忍心。曾國藩去信安撫他的弟弟說，“既然出來帶兵，就應該以殺賊爲志向，何必以多殺爲悔此賊擄人殺人之多，流毒南方。所稱的天父天兄之教，天燕天豫之官，就算周王孔聖生在今天，也絕沒有不力謀誅滅的道理既然下決心誅滅，絕沒有以多殺爲悔之理”
曾國藩的回覆表達的是他的態度，那就是對太平軍信仰上的不認同。以事實判斷，安慶的太平軍已經被包圍了兩年後才戰敗，這顯然是鐵桿的長毛，是不可能拉攏過來的，所以還是殺掉的好。
還有一種說法是，曾國藩當時帶兵十年，多次感嘆不願讓後人再帶兵，那他就要把所有的事情做徹底，也就是不能留後患，所以才斬草除根。
無論以何種方式判斷，一旦曾國藩攻佔天京，那裏的太平軍和家屬恐怕不會有好下場，要麼全部戰死，要麼全部被屠殺。這也是爲什麼太平軍跟清軍的作戰十分勇敢的原因，因爲他們知道沒有活路。